Table compiled by Marc Lacroix (2011)
Deletions Non-reciprocal translocations der(5)t( 5;9)(q35;q34) : SQSTM1-NUP214 der(18)t(3;18)(p21;q21) : MALT1-MAP4 der(X)t(X;17)(p11;q25) : ASPSCR1-TFE3 Dicentric aberrations (dic) dic(8;11)(p12;q14) : ODZ4-NRG1 dic(9;12)(p13;p12) : PAX5-SLCO1B3 dic(9;12)(p13;p13) : PAX5-ETV6 dic(9;18)(p13;q11) : PAX5-ZNF521 dic(9;20)(p11-13;q11) : PAX5-ASXL1 Insertions ins(3;3)(q26;q21q26): RPN1-EVI1 ins(4;11)(q21;q23q23) : AFF1-DSCAML1 ins(5;11)(q31;q13q23) : MLL-AFF4 ins(8)(q12;q11q11) : TCEA1-PLAG1 ins(8;21)(q22;q22q22) : RUNX1-RUNX1T1 ins(9;4)(q33;q12q25) : CDK5RAP2-PDGFRA ins(9;12)(p23;q12q15): HMGA2-NFIB ins(10;11)(p12;q23q13) : MLL-MLLT10 ins(10;11)(p12;q23) : MLL-NEBL ins(11;9)(q23;q34) : MLL-FNBP1 ins(11;17)(q23;q21) : MLL-ACACA ins(11;19)(q23;p13.2) : MLL-VAV ins(11;X)(q23;q28q13.1) : MLL-FLNA ins(12;8)(p11;p11p22) : FGFR1OP2-FGFR1 ins(15;17)(q22;q21q21) : PML-RARA ins(16)(q22p13p13) : CBFB-MYH11 ins(21;8)(q22;q13q22) : RUNX1-RUNX1T1 ins(21;8)(q22;q21q22) : RUNX1-RUNX1T1 ins(21;8)(q22;q22q22) : RUNX1-RUNX1T1 ins(21;22)(q22;q12q12) : EWSR1-ERG ins(22;9)(q11;q34q34) : BCR-ABL1 ins(X;11)(q24;q23): MLL-SEPT6 Inversions inv(1)(q21q23) : TPM3-NTRK1 inv(1)(q21q31) : TPM3-TPR inv(1)(q23q31) : TPR-NTRK1 inv(2)(p21p23) : EML4 – ALK inv(2)(p23;q11-13) : RANBP2 – ALK inv(2)(p23q35) : ATIC – ALK inv(3)(q21q26) : RPN1-EVI1 inv(6)(p21q21) : HMGA1-LAMA4 inv(7)(p15q34) : TRB@-HOXA10 inv(7)(p15q34) : TRB@-HOXA9 inv(7)(p15q34) : TRB@-HOXA11 inv(7)(q21-22;q34) : AKAP9-BRAF inv(8)(p11q13) : MYST3-NCOA2 inv(8)(q12q12) : CHCHD7-PLAG1 inv(10)(q11q11) : NCOA4-RET inv(10)(q11.2q21) : CCDC6-RET inv(11)(p15q22) : NUP98-DDX10 inv(11)(p15.3q23) : MLL-NRIP3 inv(11)(q13q23) : MLL-FNBP1 inv(11)(q13.4q23) : MLL-C2CD3 inv(11)(q14q23) : MLL-PICALM inv(11)(q21q23) : MLL-MAML2 inv(11)(q23q23) : MLL-UBE4A inv(12)(q14q15): HMGA2-WIF1 inv(14)(q11q32) : CEBPE-IGH@ inv(14)(q11q32) : IGH@-TRA@ inv(14)(q11q32) : TRA@/TRD@-TCL1A inv(14)(q11.2q32.31): BCL11B-TRD@ inv(16)(p13q22) : CBFB-MYH11 inv(22)(q12q12) : EWSR1-PATZ1 inv(X)(p11.2;q12) :NONO-TFE3 Ring chromosome r(8)(p12q12) : FGFR1-PLAG1 Balanced translocation t(1;1)(p36;q41) : DUSP10-PRDM16 t(1;2)(p13;q37) : COL6A3-CSF1 t(1;2)(p22;p11) : IGK@-BCL10 t(1;2)(q25;p23) : TPM3 – ALK t(1;3)(p32;p21) : TAL1-TCTA t(1;3)(p36;q21) : RPN1-PRDM16 t(1;3)(p36;q21) : PSMD2-PRDM16 t(1;3)(q21;q11) : TFG-NTRK1 t(1;3)(q25;q27) : GAS5-BCL6 t(1;3)(q32;q27) : SLC45A3-ETV5 t(1;3;5)(p36;p21;q33) : WDR48-PDGFRB t(1;5)(q21;q33) : TPM3-PDGFRB t(1;5)(q21;q33) : PDE4DIP-PDGFRB t(1;5;11)( ?;q33;p13) : GPIAP1-PDGFRB t(1;7)(p32;q34) : TAL1-TRB@ t(1;7)(p34;q34) : LCK-TRB@ t(1;7)(q32;p21) : SLC45A3-ETV1 t(1;9)(p34;q34) : SFPQ-ABL1 t(1;9)(q24;q34) : RCSD1-ABL1 t(1;10)(p13;q11) : TRIM33-RET t(1;10)(q21;q11) : RET-NTRK1 t(1;11)(p32;q23) : MLL-EPS15 t(1;11) (q21;q23) : MLL-MLLT11 t(1;11)(q24;p15) : NUP98-PRRX1 t(1;12)(p36;p13) : ETV6-MDS2 t(1;12)(q21;p13) : ARNT-ETV6 t(1;12)(q25;p13) : ABL2-ETV6 t(1;13)(p36;q14) : PAX7-FOXO1 t(1;14)(p22;q32) : BCL10-IGH@ t(1;14)(p32;q11) : TAL1-TRD@ t(1;14)(p34;q32) : IGH@-LAPTM5 t(1;14)(q21;q32) : BCL9-IGH@ t(1;14)(q21;q32) : IGH@-FCRL4 t(1;14)(q21;q32) : FCGR2B-IGH@ t(1;14)(q21-q22;q32) : MUC1-IGH@ t(1;14)(q25;q32) : IGH@-LHX4 t(1;17)(p34;p13) : THRAP3-USP6 t(1;19)(q23;p13) : MEF2D-DAZAP1 t(1;19)(q23;p13) : TCF3-PBX1 t(1;21)(p35;q22) : RUNX1-YTHDF2 t(1;21)(p36;q22) : RUNX1-PRDM16 t(1;21)(q21;q22) : RUNX1-ZNF687 t(1;22)(p13;q13) : RBM15-MKL1 t(1;22)(q21;q11) : BCL9-IGL@ t(1;22)(q23;q12) : EWSR1-PBX1 t(2;2)(p23;q11-q13) : RANBP2 – ALK t(2;2)(p23;q36) : PAX3–NCOA1 t(2;3)(p11-p12;q27) : IGK@-BCL6 t(2;3)(p23;q21) : TFG – ALK t(2;3)(q13;p25) : PAX8-PPARG t(2;4)(p22;q12) : STRN-PDGFRA t(2;4)(p23;q21) : SEC31A – ALK t(2;5)(p21;q33) : SPTBN1-PDGFRB t(2;5)(p23;q35) : NPM1 – ALK t(2;7)(p11;q21) : CDK6-IGK@ t(2;8)(p11;q24) : IGK@ -MYC t(2;8)(p11;q24) : IGK@-PVT1 t(2;8)(p23;p11.2) : MYST3-ASXL2 t(2;11)(p11;q13) : IGK@-CCND1 t(2;11)(p23;p15) : CARS – ALK t(2;11)(q11;q23) : MLL-AFF3 t(2;11)(q31;p15) : NUP98-HOXD11 t(2;11)(q31;p15) : NUP98-HOXD13 t(2;11)(q37;q23) : MLL-SEPT2 t(2;12)(p11;p13) : IGK@-CCND2 t(2;12)(q37;q14) : HMGA2-CXCR7 t(2;13)(q35-q36;q14) : PAX3-FOXO1 t(2;14)(p13;q32) : BCL11A-IGH@ t(2;16)(q35;p11) : FUS- FEV t(2;17)(p23;q23) : CLTC – ALK t(2;17)(p23;q25) : RNF213 – ALK t(2;18)(p11;q21.3) : IGK@-BCL2 t(2;18)(p11;q21) : IGK@- KDSR t(2;18)(q11.2;q21.33) : AFF3-BCL2 t(2;19)(p11-p12;q13) IGK@-BCL3 t(2;19)(p23;p13.1) : TPM4 – ALK t(2;21)(q11;q22) : RUNX1–AFF3 t(2;22)(p23;q11.2) : CLTCL1-ALK t(2;22)(p23;q11.2-q12) : MYH9 – ALK t(2;22)(q31;q12) : EWSR1-SP3 t(2;22)(q33-q35;q12) : EWSR1-FEV t(2;22)(q33;q12) : EWSR1-CREB1 t(3;3)(q21;q26) : RPN1-EVI1 t(3;3)(q21;q26) : C3ORF27-EVI1 t(3;3)(q25;q27) : MBNL1-BCL6 t(3;3)(q27;q27) : BCL6-ST6GAL1 t(3;3)(q27;q28) : EIF4A2-BCL6 t(3;3)(q27;q29) : TFRC-BCL6 t(3;4)(q27;p13) : RHOH-BCL6 t(3;5)(p21-25;q31-35) : GOLGA4-PDGFRB t(3;5)(p21;q33) : RBM6-CSF1R t(3;5)(p24;q35) : NSD1-ANKRD28 t(3;5)(q25;q34) : NPM1-MLF1 t(3;5;11)(p25;q35;p15) : ANKRD28-NUP98 t(3;6)(q26;q25) : TBL1XR1-RGS17 t(3;6)(q27;p12) : HSP90AB1-BCL6 t(3;6)(q27;p21) : PIM1-BCL6 t(3;6)(q27;p21): SFRS3-BCL6 t(3;6)(q27;p22) : BCL6-HIST1H4I t(3;6)(q27;q15) : BCL6-SNHG5 | Balanced translocations (continued) t(3;7)(q27;p12-13) : IKZF1-BCL6 t(3;7)(q27;q32) : BCL6-FRA7H t(3;8)(q27;q24.1) : BCL6-MYC t(3;8)(p21;q12) : PLAG1-CTNNB1 t(3;9)(p14;p13) : PAX5-FOXP1 t(3;9)(q12;q31) : TFG-NR4A3 t(3;9)(q27;p11) : BCL6-GRHPR t(3;9)(q27;p24) : DMRT1-BCL6 t(3;11)(p21;q23) : NCKIPSD-MLL t(3;11)(p21.3;q23) : MLL-DCP1A t(3;11)(p24;p15) : NUP98 TOP2B t(3;11)(q12.2;p15.4) : NUP98-LNP1 t(3;11)(q21;q23) : MLL-EEFSEC t(3;11)(q25;q23) : MLL-GMPS t(3;11)(q27;q23) : BCL6-POU2AF1 t(3;11)(q28;q23) : MLL-LPP t(3;11)(q29;p15) : NUP98-IQCG t(3;12)(p14;q15) : HMGA2-FHIT t(3;12)(q26;p13) : ETV6-EVI1 t(3;12)(q27;p13) : GAPDH-BCL6 t(3;12)(q27;q12) : BCL6-LRMP t(3;12)(q27;q15) : HMGA2-LPP t(3;12)(q27;q23) : BCL6-NACA t(3;13)(q27;q14) : LCP1-BCL6 t(3;14)(p14;q32) : IGH@-FOXP1 t(3;14)(q27;q32) : BCL6-IGH@ t(3;14)(q27;q32) : HSP90AA1-BCL6 t(3;16)(q27;p11) : IL21R-BCL6 t(3;16)(q27;p13) : CIITA-BCL6 t(3;17)(q21;p13) : CNBP-USP6 t(3;17)(q26;q22) : EVI1-(unknown) t(3;19)(q27; q13) : BCL6-NAPA t(3;21)(q26;q22) : RUNX1-RPL22P1 t(3;21)(q26;q22) : RUNX1-MDS1 t(3;21)(q26;q22) : RUNX1-EVI1 t(3;21)(q27;q22) : TMPRSS2-ETV5 t(3;22)(q27;q11) : BCL6-IGL@ t(4;5)(q21;q33) : PRKG2-PDGFRB t(4;6)(p15;q22) : SLC34A2-ROS1 t(4;10)(q12;p11) : KIF5B-PDGFRA t(4;11)(p12;q23) : MLL-FRYL t(4;11)(q21-q23;p15) : NUP98 - RAP1GDS1 t(4;11)(q21;q23) : MLL-AFF1 t(4;11)(q21;q23) : MLL-SEPT11 t(4;11)(q35;q23) : MLL-SORBS2 t(4;12)(p16;p13) : ETV6-FGFR3 t(4;12)(q11;p13) : CHIC2-ETV6 t(4;12)(q12;p13) : ETV6-PDGFRA t(4;14)(p14;q32) : IGH@-RHOH t(4;14)(p16.3;q32.3) : IGH@-FGFR3 t(4;14)(p16;q32) : IGH@-WHSC1 t(4;16)(q26;p13) : IL2-TNFRSF17 t(4;17)(q12;q21) : FIP1L1-RARA t(4;19)(q35;q13) : CIC-DUX4 t(4;21)(q31;q22) : RUNX1-SH3D19 t(4;22)(q12;q11.2) : BCR-PDGFRA t(4;22)(q35;q12) : DUX4-EWSR1 t(5;6)(q32-q33;q22) : CD74-ROS1 t(5;7)(q31;q34) : FCHSD1-BRAF t(5;7)(q33;q11.2) : HIP1-PDGFRB t(5;7)(q35.1;q21) : CDK6-TLX3 t(5;8)(p13;q12): LIFR-PLAG1 t(5;9)(q14.1;p24.1) : SSBP2-JAK2 t(5;9)(q31-q32;p22-p24.3) : KANK1-PDGFRB t(5;9)(q33;q22) : ITK-SYK t(5;10)(q33;q21): CCDC6-PDGFRB t(5;11)(q12;q23) : MLL-CENPK t(5;11)(q31;q23) : MLL-AFF4 t(5;11)(q31;q23) : MLL-ARHGAP26 t(5;11)(q33;p13) : CAPRIN1-PDGFRB t(5;11)(q35;p15.5) : NUP98-NSD1 t(5;12)(q31;p13) : ETV6-ACSL6 t(5;12)(q33;p13) : ERC1-PDGFRB t(5;12)(q33;p13) : ETV6-PDGFRB t(5;12)(q33;q14) : HMGA2-EBF1 t(5;12)(q33;q24) : GIT2-PDGFRB t(5;14)(q31;q32) : IGH@-IL3 t(5;14)(q33;q22) :NIN-PDGFRB t(5;14)(q33;q32) : PDGFRB-CCDC88C t(5;14)(q33;q32) : TRIP11-PDGFRB t(5;14)(q35;q11) : RANBP17-TRD@ t(5;14)(q35;q11) : TRD@-NKX2-5 t(5;14)(q35;q11) : TRD@-TLX3 t(5;14)(q35;q32) : TLX3-BCL11B t(5;14)(q35.1;q32.2) : BCL11B-NKX2-5 t(5;15)(q33;q15) : TP53BP1-PDGFRB t(5;16)(q33;p13) : NDE1-PDGFRB t(5;17)(q33;p11.2) : SPECC1-PDGFRB t(5;17)(q33;p11.2) : PDGFRB-CYTSB t(5;17)(q33;p13) : RABEP1-PDGFRB t(5;17)(q33-34;q11.2) : MYO18A-PDGFRB t(5;17)(q34;q21) : NPM1-RARA t(5;21)(q13;q22) : RUNX1-(unknown) t(6;7)(p21;p15) : JAZF1-PHF1 t(6;7)(q23;q34) : TRB@-MYB t(6;7)(q23;q36) : MYB-MNX1 t(6;8)(q27;p12) : FGFR1OP-FGFR t(6;9)(p23;q34) : DEK-NUP214 t(6;9)(q22–q24;p21–p23) : MYB-NFIB t(6;10)(p21;p11) : EPC1-PHF t(6;10)(p21.3;q11.2) : TRIM27-RET t(6;11)(p21;q12-q13) : MALAT1-TFEB t(6;11)(q12;q23) : MLL-SMAP1 t(6;11)(q21;q23) : MLL-FOXO3 t(6;11)(q24;p15) : NUP98-CCDC28A t(6;11)(q27;q23) : MLL-MLLT4 t(6;12)(q23;p13) : ETV6-STL t(6;14)(p21;q23-24) : HMGA1-RAD51L1 t(6;14)(p21;q32): IGH@-CCND3 t(6;14)(p22;q32) : IGH@-ID4 t(6;14)(p25;q32) : IGH@-IRF4 t(6;22)(p21;q11) : IGL@-CCND3 t(6;22)(p21;q12) : EWSR1-POU5F1 t(7;7)(p15;p21) : HNRPA2B1-ETV1 t(7;7)(p15;q34) : TRB@-HOXA10 t(7;8)(q21;ql2) : COL1A2-PLAG1 t(7;8)(q21;ql2) : HAS2-PLAG1 t(7;8)(q34;p11) : TRIM24-FGFR1 t(7;9)(q11;p13) : PAX5-ELN t(7;9)(q34;q32) : TRB@-TAL2 t(7;9)(q34;q34) : NOTCH1-TRB@ t(7;10)(q34;q11) : TRIM24-RET t(7;10)(q34;q24) : TLX1-TRB@ t(7;11)(p15;p15) : NUP98-HOXA9 t(7;11)(p15;p15) : NUP98-HOXA11 t(7;11)(p15;p15) : NUP98-HOXA13 t(7;11)(p22.1;q23) : MLL-TNRC18 t(7;11)(q21;q23) : CDK6-MLL t(7;11)(q34;p13) : TRB@-LMO2 t(7;11)(q34;p15) : TRB@-LMO1 t(7;12)(p22;q13) : ACTB-GLI1 t(7;12)(q34;p13) : TRB@-CCND2 t(7;12)(q36;p13) : MNX1-ETV6 t(7;14)(q21;q32) : CDK6-IGH@ t(7;14)(q21;q32) : IGH@-ERVWE1 t(7;14)(q34;q11) : TRA@-TRB@ t(7;14)(p14;q32) : TRG@-IGH@ t(7;14)(q35;q32.1) : TRB@-TCL1A t(7;15)(p21;q21) : C15ORF21-ETV1 t(7;16)(q33;p11) : FUS-CREB3L2 t(7;17)(p15;q11-q21) : JAZF1-SUZ12 t(7;17)(p15;q23) : MSI2-HOXA9 t(7;19)(q34;p13) : LYL1-TRB@ t(7;21)(p21;q22) : TMPRSS2-ETV1 t(7;21)(p22;q22) : RUNX1-USP42 t(7;22)(p21;q12) : ETV1-EWSR1 t(7;22)(q21;q11) : IGL@-CDK6 t(8;9)(p12;q23) : CEP110-FGFR1 t(8;9)(p22;p24) : PCM1-JAK2 t(8;9)(q24;p13) : MYC-ZBTB5 t(8;9)(q24;p13) : MYC-ZCCHC7 t(8;10)(p22;q11) : PCM1-RET t(8;11)(p11;p15) : NUP98-WHSC1L1 t(8;11)(p12;q14) : ODZ4-NRG1 t(8;12)(p11-p12;q15) : CPSF6-FGFR1 t(8;12)(q13;p13) : ETV6-NCOA2 t(8;12)(q21;q22) : BTG1-MYC t(8;12)(q22;q15) : COX6C-HMGA2 t(8;13)(p12;q12) : ZMYM2-FGFR1 t(8;14)(q11;q32) : IGH@-CEBPD t(8;14)(q24;q11) : TRA@-MYC t(8;14)(q24;q11) : TRD@-PVT1 t(8;14)(q24;q32) : MYC-IgH@ t(8;16)(p11;p13) : MYST3-CREBBP t(8;17)(p12;q11) : MYO18A-FGFR1 t(8;19)(p11;q13) : MYST3-(unknown) t(8;19)(q24;q13.1) : MYC-BCL3 t(8;20)(p11;q13) : MYST3-NCOA3 t(8;21)(q21-q22;q22) : RUNX1-RUNX1T1 t(8;21)(q23;q22) : ZFPM2-RUNX1 t(8;21)(q24;q22) : RUNX1-TRPS1 t(8;22)(p11;q13) : MYST3-EP300 t(8;22)(p12;q11) : BCR-FGFR1 t(8;22)(p21;q12) : PPP2R2A-CHEK2 t(8;22)(q24;q11) : IGL@-MYC t(8;22)(q24;q11) : IGL@-PVT1 t(9;9)(p21;p21) : MTS2-MTS1 t(9;9)(q34;q34) : NUP214-ABL1 t(9;9)(q34;q34) : SET-NUP214 t(9;10)(q34;q22.3) : ZMIZ1-ABL1 t(9;11)(p22;p15) : NUP98-PSIP1 t(9;11)(p22;q23) : MLL-MLLT3 t(9;11)(q34;p15) : NUP98-PRRX2 | Balanced translocations (continued) t(9;11)(q34;q23) : MLL-DAB2IP t(9;11)(q34;q23) : MLL-FNBP1 t(9;12)(p13;p13) : PAX5-ETV6 t(9;12)(p22-p23;q14) 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