During cancer progression, specific genomic aberrations arise that can determine the scope of the disease and can be used as predictive or prognostic markers. The detection of specific gene amplifications or deletions in single blood-borne or disseminated tumour cells that may give rise to the development of metastases is of great clinical interest but technically challenging. In this study, we present a method for quantitative high-resolution genomic analysis of single cells. Cells were isolated under permanent microscopic control followed by high-fidelity whole genome amplification and subsequent analyses by fine tiling array-CGH and qPCR. The assay was applied to single breast cancer cells to analyze the chromosomal region centred by the therapeutical relevant EGFR gene. This method allows precise quantitative analysis of copy number variations in single cell diagnostics.
Source: Quantitative high-resolution genomic analysis of single cancer cells. Hannemann J, Meyer-Staeckling S, Kemming D, Alpers I, Joosse SA, Pospisil H, Kurtz S, Görndt J, Püschel K, Riethdorf S, Pantel K, Brandt B (Burkhard.Brandt@uksh.de). PLoS One. 2011;6(11):e26362.
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Durant la progression du cancer, des aberrations génomiques spécifiques surviennent, qui peuvent déterminer la portée de la maladie et peuvent être utilisés comme marqueurs prédictifs ou pronostiques. La détection d’amplifications ou de délétions géniques spécifiques dans des cellules circulantes pouvant donner lieu à métastases est d’un grand intérêt clinique, mais techniquement difficile. Dans cet article, nous présentons une méthode pour l’analyse génomique quantitative à haute résolution de cellules individuelles. Les cellules ont été isolées sous contrôle microscopique et traitées par amplification à haute fidélité du génome entier, suivie d’analyse par « array-CGH » et « qPCR ». Le test a été appliqué à des cellules cancéreuses du sein uniques afin d'analyser la région chromosomique centrée sur le gène EGFR. La méthode proposée permet l'analyse quantitative précise des variations du nombre de copies dans une cellule unique.
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